Pyedflib錯誤讀取信號

我收集了包含EEG信號數據的EDF文件。我使用pyedflib來訪問這些文件，但是我經常很難從某些文件讀取信號。基本上，當我嘗試讀取信號值時，有許多文件可以獲得所有0的數組。鑑於：Pyedflib錯誤讀取信號

def get_sig(fname): 
    import pyedflib 
    f=pyedflib.EdfReader(fname) 
    file_dur=f.getFileDuration() 
    fs=int(inFile.getSignalHeader(0)['sample_rate']) 
    chan_names=f.getSignalLabels() 
    #note... channel names and file duration are captured correctly 

    sig=f.readSignal(4) 
    return sig

這將返回長*「FS」的「file_dur」的數組，但結果是全0的數組，並顯示以下警告：

read -1, less than 8965120 requested!!!

沒有人有任何想法可能會導致這樣的問題？不幸的是，我不能分享任何數據，因爲它是PHI，但是如果有任何其他信息可能會有所幫助，請問。

一對額外的注意事項：

我也試圖sig=f.readSignal(4,start=0,n=100)，以確保它不與排序的文件或任何的開頭問題，它返回的全0數組長度爲100.
當我在Matlab中檢查它們時，這些值是正確的（即非零）。
這個問題似乎是文件中的特定（部分被正確地處理，而其它的是不），但是我不能找到比實際信號以外的文件之間的任何差異值
在f.readSignal(4)使用的索引4不硬編碼在我的完整應用程序中，這僅僅用於演示目的（在我的示例文件中，4對應於EEG通道F4）。

謝謝！

P.S.我也將其添加到pyedflib wiki中。

來源

2017-09-26 CuChemist

如果使用相同的句柄，則pyedflib不會在文件之間清除。上面的代碼運行良好，但是當作爲驅動程序內部的循環實現時，我並沒有明確地關閉pyedflib文件句柄。一旦我添加f.close()後每個文件工作正常。

來源

2017-09-27 15:08:09 CuChemist

Pyedflib錯誤讀取信號

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