使文件夾從一個文件名的一部分，移動有相應的文件 - 的bash腳本

Question

在有兩個目錄 finch_data/filteredfirst /對齊 與文件

firstZBND1X.sam 
firstZBND2V.sam 
firstZBND3X.sam 
firstZBND4X.sam 
firstZBND5X.sam 

和 finch_data/filteredsec /對齊

secZBND1X.sam 
secZBND2V.sam 
secZBND3X.sam 
secZBND4X.sam 
secZBND5X.sam 

我創建了一個文件夾 finch_data/filteredsec/combined 其中我移動了所有第一個* .sam和sec * .sam文件。

現在我需要使用前綴first或sec和.sam之間的文件manes來創建單個子文件夾。因此，文件夾，如：

ZBND1X 
ZBND2V 
ZBND3X 
ZBND4X 
ZBND5X 

然後，我需要與那些名稱字符串的文件移動到這些對應的文件夾。

任何人用一行bash來做到這一點？

這是接近我是從其他論壇

find . -name "*.sam" -exec sh -c 'mkdir "${1%.*}" ; mv "$1" "${1%.*}" ' _ {} \; 

Answer 1

這將做它用first（做同樣爲sec）爲前綴的文件有：

#!/bin/bash 

prefix=first 
for file in ${prefix}*; do 
    base="${file%.sam}" 
    dir="${base#$prefix}" 
    mkdir -p "$dir" 
    mv "$file" "$dir" 
done 

這不是一個可愛的oneliner ，但它可讀。但是，如果你願意，你可以把它寫成一行。

我們只是遍歷所有文件與$prefix前綴當前目錄下，通過剝離已知的擴展和已知的前綴，然後創建目錄（如果有必要，-p計算dir名，我們沒有得到，如果目錄已經警告存在），最後移動目標目錄中的文件。如果你願意，你也可以在這裏將文件重命名爲不同的東西，也許從文件名中刪除目錄名稱，等等。