1
我在大型網絡中檢測到社區,並且在igraph Python中的模塊化程度較低。我懷疑結果。所以我在igraph R中再次嘗試。模塊化要高得多。我不知道原因。在下面,我將寫一個示例網絡和我使用的代碼。igraph R和Python中社區檢測功能的不同結果
圖表:(NcoI位格式是無向圖的第三列是重量。)
1 2 123
1 3 32
2 3 523
3 6 3
6 5 11
6 8 234
5 8 324
3 9 234
9 11 32
9 12 5534
9 13 32
11 12 322
11 13 3
12 13 32
R代碼裏面:
library(igraph)
g=read.graph('graph.ncol',format='ncol',directed=F)
c=multilevel.community(g)
modularity(c)
[1] 0.2845496
Python代碼:
import igraph
g=igraph.Graph.Read_Ncol('graph.ncol',directed=False)
c=g.community_multilevel()
c.modularity
0.4974489795918367
在我的原始網絡中,使用R和Python的社區數量大不相同。它不僅是多層次的方法。我也嘗試了fastgreedy方法。使用R和Python的結果也不同。
謝謝!我應該小心使用igraph Python。 – Ben 2014-10-27 13:06:54