匹配連字符/破折號旁邊某些字母

輸入文件：匹配連字符/破折號旁邊某些字母

>AMSF107-09|Perciformes|COI-5P|GU661092 
TAGTA- 
>AMSF114-09|Perciformes|COI-5P|GU661101 
C-ACGC 
>ANGBF3683-12|Haemulon_sp._B_JJT-2012|COI-5P|JQ741244 
-GCAGTT-CA-

我想替換連字符TAGTA-，C-ACGC，並-GCAGTT-CA-與N的，但離開頭（與>開始的行）完整。我正在尋找一個匹配A,C,G或T旁邊的連字符的正則表達式，但排除以>字符開頭的匹配項。

所需的輸出

>AMSF107-09|Perciformes|COI-5P|GU661092 
TAGTAN 
>AMSF114-09|Perciformes|COI-5P|GU661101 
CNACGC 
>ANGBF3683-12|Haemulon_sp._B_JJT-2012|COI-5P|JQ741244 
NGCAGTTNCAN

編輯：我知道正則表達式中最基礎的。到目前爲止，我已經嘗試(ACGT)?\-(ACGT)?，但匹配每個連字符。

來源

2017-08-08 cooldood3490

對，你到目前爲止嘗試過什麼？ – Utkanos

我只知道關閉正則表達式 – cooldood3490

這由A，C，G或T之前連字符相匹配：(?<=[ACGT])-

來源

2017-08-08 17:59:40 gribvirus74

的基本知識，但它也與第3個標題中的T匹配。 '> ANGBF3683-12 | Haemulon_sp._B_JJT-2012 | COI-5P | JQ741244' – cooldood3490

你在寫什麼語言？您可以添加一個簡單的方法來過濾行 – gribvirus74

我正在使用查找和替換功能編輯Sublime中的文本文件。我在查找部分放置正則表達式，在替換部分放置'N'。 – cooldood3490

所以這並不完全找到剛纔的連字符，但它會找到任何組合A，C，G，T包括- 。這裏是regex：

(?=[ACGT-]+$)(?=(?:[^-]*[-])+).*

您可能需要split這場比賽string斷並將其保存到一個臨時變量，你那麼做了.replace('-', 'N');並連接回到您的數據字符串的結尾。希望這可以幫助！

來源

2017-08-08 23:51:27

等等，這不太對。我以爲我測試過它，但它仍然有一個錯誤。我會看看我是否可以修復它，但它接近！問題是，只要你的任何給定字符已經存在於字符串中，你就可以放入任何字符或數字。我會繼續努力工作。 –

@ cooldood3490不小心粘貼了錯誤的'regex'，它現在被更新了。 –

我感謝您的幫助 – cooldood3490

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