從Gene Symbol和Vice Versa獲取SwissProt ID

Question

我是Bioconductor的新手，想要找到合適的軟件包以便能夠做我想做的事情......提供SwissProt ID並給我基因符號或反之亦然。

有很多包，我不知道我想要哪一個，任何人都有一個快速的答案？你可以採取

Answer 1

一種方法是使用生物包這樣的：

library(org.Hs.eg.db) 

假設我的基因符號就像鍵的那些位置：

keys <- c("A1BG","A2M","A2MP1","NAT1","NAT2","AACP") 

然後，你可以使用select （）方法（這適用於R-2.14及更高版本）。

select(org.Hs.eg.db, cols=c("SYMBOL", "UNIPROT"), keys= keys, keytype="SYMBOL") 

希望這會有所幫助！