奇怪的回聲行爲瓦爾

我有我希望能轉換成一個for循環下面簡單的代碼：奇怪的回聲行爲瓦爾

i="1"; \ 
plate="$(grep -P "^${i}" SampleIDs-Nov9-gyrA_S1-2.tab | cut -f 2)"; \ 
plateid="$(grep -P "^${i}" SampleIDs-Nov9-gyrA_S1-2.tab | cut -f 3)"; \ 
strain="$(grep -P "^${i}" SampleIDs-Nov9-gyrA_S1-2.tab | cut -f 4)"; \ 
replicate="$(grep -P "^${i}" SampleIDs-Nov9-gyrA_S1-2.tab | cut -f 5)"; \ 
timepoint="$(grep -P "^${i}" SampleIDs-Nov9-gyrA_S1-2.tab | cut -f 6)"; \ 
medium="$(grep -P "^${i}" SampleIDs-Nov9-gyrA_S1-2.tab | cut -f 7)"; \ 
total="$(awk -F'\t' 'BEGIN{n=0}{ n++ }END{print n/4}' ../trial1_merged_dir/${i}.extendedFrags.fastq)"; \ 

mut="$(grep -P "^${strain}" mutants-short.unix.txt | awk '{print toupper($2)}')"; \ 
wt="$(grep -P "^${strain}" mutants-short.unix.txt | awk '{print toupper($3)}')"; \ 

mutc="$(grep -c $mut ../trial1_merged_dir/${i}.extendedFrags.fastq)"; \ 
wtc="$(grep -c $wt ../trial1_merged_dir/${i}.extendedFrags.fastq)"; \ 

echo $i; \ 
echo $strain; \ 
echo $medium; \ 
echo $replicate; \ 
echo $timepoint; \ 
echo $wtc; \ 
echo $mutc; \ 
echo $total; \

輸出：

1 
cip1 
M9_Glucose 
1 
T0 
4794 
2938 
9289

這是正常的。然而，當我與一個取代最後8行回聲：

echo "$strain $i $medium $replicate $timepoint $wtc $mutc $total"; \

輸出：

1 T0 4794 2938 9289

不正常。我想知道有什麼可能導致一些價值觀的藥房？

還有一次，我嘗試了，我得到這個輸出：

1 1ip1 T0_Gluco4794 2938 9289

更爲離奇的是一些文本融合，結果被截斷。

來源

2017-12-02 AdrianP.

什麼是所有的反斜槓？ – chepner

'; 「在行尾沒有任何意義。行尾的'\'告訴shell下一行是這個行的延續，但是'''本質上就是將行後面的行作爲單獨行。他們相互取消了！把它們都關掉。另外，你應該總是在變量引用周圍放置雙引號，如'grep -c「$ mut」'和'echo「$ i」'。我總是推薦[shellcheck.net]（http://www.shellcheck.net）開始編寫腳本，因爲它會指出代碼中的常見錯誤。 –

$medium最後有一個CR。在提取變量後將其刪除，或使用dos2unix對文件進行預處理。

來源

2017-12-02 20:18:40

哎唷！從來沒有想過。謝謝！ –

奇怪的回聲行爲瓦爾

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