在matplotlib中進行實時繪圖，同時執行需要時間的測量

我想在測量結果爲運行時執行測量並繪製圖形。這個測量需要一段時間的python（它必須通過慢速連接檢索數據）。問題是測量時圖形凍結。測量包括設置中心波長，然後測量一些信號。在matplotlib中進行實時繪圖，同時執行需要時間的測量

我的計劃看起來是這樣的：

# this is just some arbitrary library that has the functions set_wavelength and 
# perform_measurement 
from measurement_module import set_wavelength, perform_measurement 
from pylab import * 

xdata = np.linspace(600,1000,30) # this will be the x axis 
ydata = np.zeros(len(xdata)) # this will be the y data. It will 
for i in range(len(xdata)): 
    # this call takes approx 1 s 
    set_wavelength(xdata[i]) 
    # this takes approx 10 s 
    ydata[i] = perform_measurement(xdata) 
    # now I would like to plot the measured data 
    plot(xdata,ydata) 
    draw()

，當它在IPython中運行與-pylab模塊接通，但測量運行時這一數字將凍結這將工作。如何修改的行爲在測量時有交互式繪圖？

你不能簡單地使用pylab.ion（），因爲python在執行測量時很忙。

問候，

德克

來源

2012-03-18 Dirklinux

慢速輸入和輸出是使用線程和隊列在Python的最佳時機。線程有其侷限性，但這種情況下，他們輕鬆有效地工作。

的如何執行此概要：
通常，GUI（例如，matplotlib窗口）需要在主線程，所以做數據集合中的第二線程。在數據線程中，檢查是否有新的數據進入（如果您在某種類型的無限輪詢循環中執行此操作，請稍等片刻以釋放線程）。然後，在需要時，讓主線程知道有一些新數據需要處理/顯示。具體如何做到這一點取決於程序和GUI的細節等。您可以在數據線程中使用一個標誌，您可以從主線程或theading.Event中檢查該標誌，或者，例如，如果您有wx後端用於matplotlib wx.CallAfter很簡單。我建議通過其中一個Python線程教程來了解它，並且使用GUI進行線程通常也有一些問題，所以只需在您的特定後端線程上快速執行一次谷歌即可。這聽起來很麻煩，因爲我簡短地解釋了它，但它非常簡單而且功能強大，並且比從不同進程讀取和寫入同一文件更順暢。

來源

2012-03-20 16:37:46 tom10

好的，那是我最初的想法，但你會怎麼做？如果繪圖是在一個單獨的線程中，它將無濟於事，因爲程序將在主線程中忙碌。你能舉個例子嗎？ – Dirklinux 2012-03-21 12:42:19

我在答案中給出了更詳細的大綱。在這裏回答你的問題：關於「程序將在主線程中忙碌」，因爲你的數據收集是硬件有限的，你的程序在數據收集線程中並不真正「忙碌」，它主要只是在等待數據。至少在我的經驗中，線程在數據收集程序中運行得很好。 – tom10 2012-03-21 15:40:18

非常感謝！將嘗試它，並讓你張貼。 – Dirklinux 2012-03-22 10:53:40

可以，但也許有點尷尬，運行數據收集爲serparate過程。我發現子進程模塊中的Popen非常方便。然後讓該數據收集腳本將其在磁盤上的某處保存，並使用

Popen.poll()

檢查它是否已完成。

它應該工作。

來源

2012-03-19 13:46:01 deinonychusaur

感謝您的迴應，它幫助！我將編寫一個可以使用Popen與繪圖程序進行通信的測量程序，並使用Popen.communicate()將測量數據發回。這樣我就可以爲不同的程序重寫測量程序，並仍然使用相同的繪圖程序。甚至可能使用套接字，所以我可以在一臺計算機上測量並在另一臺計算機上繪製結果。 – Dirklinux 2012-03-19 18:19:49

我建議緩衝大數據塊中的數據，並在緩衝區填滿時進行渲染/重新渲染。如果你希望它是非阻塞的看greenlets。

from gevent.greenlet import Greenlet 
import copy 
def render(buffer): 
    ''' 
    do rendering stuff 
    ''' 
    pass 

buff = '' 
while not_finished: 
    buff = connection.read() 
    g = Greenlet(render, copy.deepcopy(buff)) 
    g.start()

來源

2012-03-19 18:18:18 lukecampbell

看看Traits和Chaco，Enthought的類型系統和繪圖庫。他們提供了一個很好的抽象來解決你遇到的問題。一旦Chaco的任何依賴關係發生變化，它就會自行更新。

來源

2012-03-21 15:44:42 MRocklin

在matplotlib中進行實時繪圖，同時執行需要時間的測量

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