合併基於從多個文件三列

Question

我想用pd.merge近10個文件每個文件都有數據是這樣的，

chrom start end name score strand splice_site acceptors_skipped exons_skipped donors_skipped anchor known_donor known_acceptor known_junction genes transcripts 
4  3487839 3491240 JUNC00148541 101 - GT-AG 2 1 3 DA 1 1 1 Tmem68 ENSMUST00000029891,ENSMUST00000108388,ENSMUST00000154922 
4  3489293 3491240 JUNC00148543 1 - GT-AG 1 0 1 DA 1 1 1 Tmem68 ENSMUST00000029891,ENSMUST00000108388,ENSMUST00000154922 

我已經在過去使用合併使用pd.merge(df_a, df_b, on='gene', how='outer')通過合併只有一列，在這裏我想根據鉻，開始和結束和鏈合併它們。

我的新DF會是什麼樣子

chrm:start-end(strand) score_file1 score_file2 ...file10 gene_name splice_site acceptores exon_skipped donors_skipped...transcripts 

如果沒有匹配how='outer'我相信會進入NaN值。如何減少內存使用量，最好的方法是什麼？

path = r'/Users/PycharmProjects/' 
all_files = glob.glob(os.path.join(path, "*_bed.txt")) 
print(all_files) 
df1 = pd.read_table(all_files[0]) 
df2= pd.read_table(all_files[1]) 

concatnated_df = pd.merge(df1,df2, on=['genes','chrom','start','end'], how='outer') 
print(concatnated_df.head(n=5)) 

任何幫助表示讚賞！

更新簡化問題：

chr start end score strand gene 
1 20 30 50 -  abc1 
2 40 50 50 +  cdf1 

10這樣的數據CSV文件，在CHR合併它們基於（精確匹配），起始端和基因 新的DF

chr start end score_file1 score_file2..file10 strand gene 
1 20 30 50 20 40 -  abc1 
2 40 50 50 30 50 +  cdf1 

Answer 1

dfs = [df1[['chr','gene','start','end','score']], 
     df2[['chr','gene','start','end','score']], 
     df3[['chr','gene','start','end','score']], 
     df10[['chr','gene','start','end','score']]] 
df_final = reduce(lambda left,right: pd.merge(left,right,on= 
        ['gene','chr','start','end'], how='outer'),dfs)