可用線程着陸

我編程上的騎士登陸，其具有68芯和4個超線程/核心節點。我正在研究混合MPI/OpenMP應用程序。我的問題是，如果4個超線程意味着用作OpenMP的線程或者我如何使用他們？當我運行使用以下方案我的程序：可用線程着陸

export OMP_NUM_THREADS=1 
mpirun -np 68 ./app

它的運行速度比當我使用的方案更快：

export OMP_NUM_THREADS=4 
mpirun -np 68 ./app

也許問題是，對於一個特定的MPI線程不接近彼此。但是，我不知道該怎麼做。

總之，我可以使用4個超線程/芯作爲OpenMP的線程？

謝謝。

來源

2017-10-21 armando

在絕大多數的應用程序，也就會跑這麼多線程，同時運行在每個核心的MPI排名沒有用。英特爾MPI的默認設置應該是將本地線程放置在線程中，但首先驗證您的OpenMP在單個MPI等級上顯示增益，使用2或4個內核，然後嘗試可能的等級和線程數組合。 – tim18

關於如何設置親和力的細節因MPI實現而異，但針對KNL的MPI應包含該功能。 – tim18

我還沒有足夠的經驗與knl說，一個應用程序使用多於1個線程每個內核有效可能會在所有內核使用前達到峯值。在knc上，mpi可能會保持核心繁忙的消息傳遞以及另一個正在運行的os和mpi。 – tim18

正如你可能使用英特爾MPI和OpenMP運行時，請允許我轉發你提供有價值的信息的一些鏈接的釘扎MPI和OpenMP線程到處理器核心/線程。過程/線程綁定是當今實現高性能所必需的。即使操作系統試圖盡最大努力，將一個進程/線程從一個內核/線程移動到另一個位置也意味着數據也需要傳輸。對於這個問題，看看Running an MPI/OpenMP Program和Environment Variables for Process Pinning。例如，如果您以68個MPI排名運行，那麼您可能會開始將每個MPI排名放入不同的核心。您可以通過設置I_MPI_DEBUG環境變量（如here所述）來仔細檢查mpirun是否正在履行您的請求。

來源

2017-10-24 09:29:58 Harald

可用線程着陸

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