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subprocess.check_output更快的方式

2013-04-30 41 views
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prules=subprocess.check_output("perl ruleFinder.pl "+datasetfile+" "+myrulepath, shell=True)##call a different program to produce a list of rules that predict contact

我正在使用此代碼調用另一個程序，並從該程序中獲取數據。使用這個過程需要大約一分鐘的時間。有更快的更有效的功能我可以使用嗎？subprocess.check_output更快的方式

來源

2013-04-30 miik

+1

需要多長時間從shell（或命令提示符）運行相同的命令？你確定subprocess.check_output（）是否是瓶頸？ – 2013-04-30 15:15:46

+1

真的需要使用'shell = True'嗎？它帶來了很多麻煩，特別是如果你的文件名中有空格。你試過'subprocess.check_output（['perl'，'ruleFinder.pl'，datasetfile，myrulepath]）' – glglgl 2013-04-30 15:28:52

+0

我同意'shell = True'。傳遞參數列表更清晰。 – 2013-04-30 15:30:19

回答

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subprocess.check_output只是啓動另一個進程並等待它完成。這需要一分鐘的時間，但是執行時間並沒有花費在subprocess.check_output。時間花在執行其他進程上。加快速度的唯一方法是加速其他過程。

來源

2013-04-30 15:20:01

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