如何在R中執行p.adjust？

我有一個數據幀p.value s，我想調整p.values。我用這個commad：如何在R中執行p.adjust？

Padjust = p.adjust(pvalues, "fdr")

pvalues是缺失值和fdr我的數據幀是，我想使用的方法。然而，I'm得到以下錯誤：

Error in p.adjust(pvalues, "fdr") : 
(list) object cannot be coerced to type 'double

2013-03-12 Telma_7919

p.adjust'的'第一個參數是P值的矢量，而不是一個數據幀... – alexwhan 2013-03-12 11:02:07

如果您data.frame包含：你可以然後通過調整p值添加到您的數據幀所有的p.values，也許你想使用sapply（）？ 'sapply（pvalues，p.adjust，method =「fdr」）' – 2013-03-12 11:05:07

的p.adjust第一個參數應該是一個載體，見

?p.adjust

在特定情況下，你需要從你的數據幀中選擇值並把它們傳遞給函數，那麼這樣的：

p.adjust(pvalues$p.values, "fdr")

如果列名是p.values。

pvalues$adjust = p.adjust(pvalues$p.values, "fdr")

2013-03-12 11:04:04 csgillespie

回答