R：as.numeric數據框混亂值的順序

Question

我在下面粘貼了我的代碼的重要部分。基本上我創建了一個data.frame，其中兩列包含數值，一列包含因子。

我試圖將「位置」列轉換爲數值，但是一旦我這樣做，位置值出於某種原因切換。

f <- fread("ABC.txt",header=F,skip=1)$V1 
f <- paste(f, collapse = "") 

vector <- 1:stri_length(f) 

fillmatrix <- c(rbind(strsplit(f, "")[[1]], vector)) 
A <- data.frame(1,matrix(fillmatrix, ncol=2, byrow = TRUE)) 
A <- A[c(1,3,2)] 
colnames(A)=c("Track","Location","Base") 

class(A$Track) 
# [1] "factor" 

A[1:15,] # Before as.numeric 
    Track Location Base 
# 1  1  1 A 
# 2  1  2 C 
# 3  1  3 G 
# 4  1  4 G 
# 5  1  5 A 
# 6  1  6 A 
# 7  1  7 T 
# 8  1  8 A 
# 9  1  9 A 
# 10 1  10 A 
# 11 1  11 A 
# 12 1  12 T 
# 13 1  13 T 
# 14 1  14 C 
# 15 1  15 C 

a <- transform(A, Location = as.numeric(Location), Track = as.numeric(Track)) 

a[1:15,]  # After as.numeric 
# Track Location Base 
# 1  1  1 A 
# 2  1  112 C 
# 3  1  223 G 
# 4  1  334 G 
# 5  1  445 A 
# 6  1  556 A 
# 7  1  667 T 
# 8  1  679 A 
# 9  1  690 A 
# 10 1  2 A 
# 11 1  13 A 
# 12 1  24 T 
# 13 1  35 T 
# 14 1  46 C 
# 15 1  57 C 

A數據幀相當長〜700行長。我創建數據的方式是這個問題嗎？或者我忽略了一個小錯誤？

感謝您的幫助

Answer 1

一個可重複的例子會很好。

我懷疑這是因爲class(A$Location)是一個因素，而不是一個字符。 在這種情況下，您需要as.numeric(as.character(Location))才能根據需要獲取數字。這是因爲R在做一個（字符串，不是數字 - 因此10在2之前）排序之後編碼因子就像整數1:nlevels(your.factor)。

你可以在你data.frame呼叫建立stringsAsFactors=F - 在你的fillmatrix <- ...行你似乎通過「做strsplit轉產一切字符」（？爲什麼你粘貼f在一起只是爲了回來了再拆呢）