串連每四個文件，Linux的

Question

我有存儲與文件名列表兩個文件：

FileA: 
GSM1328513 
GSM1328514 
GSM1328515 
GSM1328516 
GSM1328545 
GSM1328546 
GSM1328547 
GSM1328548 
GSM1328609 
GSM1328610 
GSM1328611 
GSM1328612 

and: 
FileB: 
    Brn 
    Hrt 
    Lng 

我想要做的是，串接在的fileA中列出的所有四個文件並命名連結文件作爲文件在FILEB上市名稱： 做手工，它看起來像：

cat GSM1328513 GSM1328514 GSM1328515 GSM1328516 > Brn 
cat GSM1328545 GSM1328546 GSM1328547 GSM1328548 > Hrt 
cat GSM1328609 GSM1328610 GSM1328611 GSM1328612 > Lng 

因爲我有文件的一個長長的清單，我想自動執行，任何人都可以幫忙。 如果有任何不清楚的地方，請指出。

Answer 1

另一種快速的方法來做到這一點不sed：

cat FileA | while read a ; do read b ; read c ; read d ; 
    echo "cat $a $b $c $d > " ; done | paste - FileB | bash 

迪迪埃Trosset說，你可以跳過| bash，看看它在執行前一樣。

其他的方法：一襯墊，而不EVAL，與礦結合@dshepherd溶液：

cat FileA | xargs -n4 echo | paste - FileB | while read a b c d e ; do cat $a $b $c $d > $e ; done 

優點：這是唯一的一個一行迄今不EVAL任何輸出（| bash），並且不使用臨時文件，並且只使用到處都可以找到的標準工具（cat,xargs,paste）。

Answer 2

這裏是shell腳本，做你想做的事

iter=0 
while read filename 
do 
    stop=`expr \($iter + 1 \) \* 4` 
    iter=`expr $iter + 1` 
    files=`head -n $stop fileA | tail -n 4 | tr '\n' ' '` 
    cat $files > $filename 
done < fileB 

Answer 3

一個內膽什麼：

cat FileA | sed 'N;N;N;s/\n/ /g;s/^/cat /;s/$/ >/;' | paste - FileB | bash 

，您可以通過刪除最後一個管道bash測試的內容將實際產生的命令。

對於FileA每一行，獲得未來三年N，轉換換行符\n爲空格，前置cat，並追加>。然後將每條生成的線-與FileB中的一條線合併。將這些命令發送到bash。

---

即使較短sed，在單個更換命令添加cat和>。

cat FileA | sed 'N;N;N;s/\n/ /g;s/.*/cat & >/;' | paste - FileB | bash 

Answer 4

另一種方法：你可以使用

cat FileA | xargs -n4 echo 

但是我想不出任何特別優雅的方式來此與來自FILEB輸出文件名結合極易產生四個文件名組。一種可能是做一些字符串處理然後評估它（就像Didier Trosset的回答）。

編輯：明白了！使用GNU平行（類似的類固醇xargs的）：

parallel < tempA -n4 -k --files cat | paste - tempB | xargs -n 2 mv 

在各組的4個參數的parallel命令運行貓並將輸出到臨時文件。它將這些臨時文件的名稱寫入stdout（並且-k表示它們按正確的順序寫出）。

paste將所需的文件名插入流中，然後我們只使用xargs -n 2 mv將臨時文件移動到所需的位置。

我用< tempA而不是cat tempA，因爲它在技術上是best practice。

與其他一行相比，優勢（在我看來）是，您不必評估字符串（例如使用bash）。

Answer 5

使用awk：

awk '{ORS=(NR%4?" ":"\n")}1' FileA | awk '{print "cat "$0" > "}' | paste - FileB | bash 

另外，使用第一步dshepherd方法：

xargs -n4 echo < FileA | awk '{print "cat "$0" >"}' | paste - FileB | bash 

我覺得這些很乾淨，可擴展性和邏輯性。

最簡單的所有的（雖然不太通用的方法，並且IMO少「漂亮」），則前面加上"cat"每個xargs分組，並在paste命令追加>作爲分隔符：

xargs -n4 echo cat < FileA | paste -d ">" - FileB | bash 

---

說明：

1. 使用awk，使各組的四行成單排。 如果記錄編號RN是模4，則用新行"\n"分開，否則單個空格空間" "。 這使輸出：

   $ awk '{ORS=(NR%4?" ":"\n")}1' FileA 
   GSM1328513 GSM1328514 GSM1328515 GSM1328516 
   GSM1328545 GSM1328546 GSM1328547 GSM1328548 
   GSM1328609 GSM1328610 GSM1328611 GSM1328612 
   

   至於建議的dshepherd，這是xargs容易做：

   $ xargs -n4 < FileA 
   GSM1328513 GSM1328514 GSM1328515 GSM1328516 
   GSM1328545 GSM1328546 GSM1328547 GSM1328548 
   GSM1328609 GSM1328610 GSM1328611 GSM1328612 
   

2. 現在，每行的內容，在前面加上cat和追加>。

   $ xargs -n4 < FileA | awk '{print "cat "$0" > "}' 
   cat GSM1328513 GSM1328514 GSM1328515 GSM1328516 > 
   cat GSM1328545 GSM1328546 GSM1328547 GSM1328548 > 
   cat GSM1328609 GSM1328610 GSM1328611 GSM1328612 > 
   

3. 從FileB加入每行的內容，用線，採用paste - FileB（該-含義從標準輸入來獲得。

   $ xargs -n4 < FileA | awk '{print "cat "$0" > "}' | paste - FileB 
   cat GSM1328513 GSM1328514 GSM1328515 GSM1328516 > Brn 
   cat GSM1328545 GSM1328546 GSM1328547 GSM1328548 > Hrt 
   cat GSM1328609 GSM1328610 GSM1328611 GSM1328612 > Lng 
   

4. 執行每行的內容作爲bash命令，通過管道到bash：

   xargs -n4 < FileA | awk '{print "cat "$0" > "}' | paste - FileB | bash 
   

---

Answer 6

使用bash陣列（bash 4或更高版本需要）。我還假設fileB中名稱的編號 與fileA中的名稱編號匹配。

readarray -t gsms < FileA 
for ((i=0; i<${#gsms[@]}; i+=4)); do 
    read fname 
    echo "${gsms[@]:i:4}" > "$fname" 
done < FileB