bash for awk的循環變量

這是我第一次發佈堆棧溢出，主要是在搜索解決方案和閱讀帖子之後。我想使用bash運行一個循環，所以我可以使用ext .u.clean對一堆不同的文件進行字符串搜索，我希望通過這些文件查看字符串「H＃」或「h＃」以及＃爲1-28，並輸出到一個文件中，該文件的字符串中搜索到的編號。我在兩個字段（$ 5和$ 0）中進行了兩次單獨搜索，我想將唯一匹配的總數輸出到文件「temp」＃.txt。在此之後，我想對文件中輸入的兩個數字進行一些數學運算。到目前爲止，我已經得到了這麼多：bash for awk的循環變量

for i in {1..28}; do 
    awk -v var="$i" -F"\t" ' $19 ~ "_[hH]"var {print $0}' */*.u.clean | \ 
     sort | uniq | wc -l > 'temp'$i'.txt' | \ 
     awk -v var="$i" -F"\t" ' $19 ~ "_[hH]"var {print $5}' */*.u.clean | \ 
     sort | uniq | wc -l >> 'chris'$i'.txt' 
done

問題是，數字出來錯了。我總共獲得了28個「temp」＃「.txt」文件，但輸入不是正確的字數。我也不知道如何做一個數學運算，我有文件中的數字。有人可以幫我解決問題嗎？或者讓我指出正確的方向？謝謝你的幫助。

編輯：

下面是一些輸入的可能是什麼樣子：

112é03 294168 FBLN7_rs335586251.5 GG
2013年1月23日2 3 VSD控制130123_CR_CH5_H26 1 一.Conservative

17 d 11 294319 FBLN7_rs335586251.5 GG
06/26/2012 2 3 VSD控制
1 20626_CR_CH5_H3 1 A.Conservative

22乙01 294703 FBLN7_rs335586251.5 GG
06/26/2012 2 2 VSD控制
120626_CR_CH5_H4 1 A.Conservative

103甲07 295033 FBLN7_rs335586251.5 GG
01 /二千○十三分之二十三2 1 VSD控制
130123_CR_CH5_H23 1 A.Conservative

44克07 295119 Tbx5_rs61931008.5 GG
2012年7月11日2 5 ASD控制
120711_CR_CH5_H12 1 A.Conservative

42 H 12 295201 JAG1_rs1232607.5 GG
2012年7月11日1 2 ASD控制
120711_CR_CH5_H12 1 A.Conservative

我試圖找到一個計數在字段19（字段Tbx5_rs61931008.5）中出現多少次，H'＃'的每次出現都是在＃從1-28出現的情況下，將該數字輸出到每個H＃的單獨文件中。然後我想知道H＃的這些匹配，字段5有多少個唯一的場合，並將該數字輸出到每個H＃的相同文件。我希望這是明確的，讓我知道它不是。謝謝。

來源

2013-03-04 charlesshaw

能否請您用一些輸入以及預期的輸出更新您的問題，因爲這會使您更容易回答您的問題？歡迎來到SO BTW :-) – 2013-03-04 20:41:43

'wc -l> file | awk ...'管道的一部分顯然是錯誤的;你的意思是'wc -l>文件; awk ...'而不是？你不能重定向到一個文件並同時繼續管道（除非像'wc -l | tee file | awk ...'，如果這是你真正想要的東西）。 – tripleee 2013-03-04 21:10:20

不幸的是，你很難理解你想要做什麼，但是至少有一個可疑的事情正在進行：你說你是......在兩個領域（$ 5和$ 0）做兩次單獨的搜索您只需打印$ 0和$ 5，您的搜索就會在$ 19 _both_次的字段中運行。編輯：沒有發現上面評論中提到的'>'問題 - 猜測那是你的主要問題。 – mikyra 2013-03-04 21:13:16

這似乎有點複雜，你試圖實現。我會建議使用find和grep

find . -name "*.u.clean" -exec egrep -c '([Hh][1-9])|([Hh][1-2][0-9])'

你必須採取輸出和做數學題

這是假設只有一個h#每行的文件中，如果這是不正確的，那麼你將需要多做一點工作。我會找到所有出現的文件，然後使用egrep -o '([Hh][1-9])|([Hh][1-2][0-9])' | wc -l來獲取每個文件的總數。

來源

2013-03-04 20:59:52 hwatkins

我想統計每個H1-H28發生的總數，而不是總數。謝謝。 – charlesshaw 2013-03-05 19:30:47

bash for awk的循環變量

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