抖動點時避免重疊

閱讀科學論文時，我經常會遇到點抖動而沒有相互重疊的情節。我懷疑他們中的很多人都是用一個名爲GraphPad Prism的程序來繪製的，但是肯定在R中必須有一種方法來做同樣的事情。雖然它不是完美的（如下面的紅點），但我認爲它看起來比隨機抖動好得多。抖動點時避免重疊

Jittered points without overlap

如果有人知道如何做到這一點，最好使用一些基本的功能，我會很高興地知道。

來源

2012-08-09 Backlin

這通常被稱爲* beeswarm情節*;在ggplot2的新版本中有一些功能可以做到這一點 – 2012-08-09 18:13:10

啊，很高興爲它命名。使它更容易找到更多。我不熟悉ggplot（總是首選格子），但我想我總是可以爲它設計一個通用功能。在CRAN中似乎有一個名爲[beeswarm]的軟件包（http://cran.r-project.org/web/packages/beeswarm/index.html），它也可以。 – Backlin 2012-08-09 19:06:55

ggplot的相關軟件包：https：//github.com/eclarke/ggbeeswarm – 2015-11-12 02:23:46

下面是使用geom_dotplot()一個GGPLOT2解決方案：

library(ggplot2) 
set.seed(1234) 

dat = data.frame(y=c(rpois(20, 4), rpois(20, 1), runif(20, 0, 20)), 
       category=rep(c("group_1", "group_2", "group_3"), c(20, 20, 20))) 

dotplot_1 = ggplot(dat, aes(x=category, y=y)) + 
      geom_dotplot(aes(fill=category), binaxis="y", 
         stackdir="center", binwidth=0.8) + 
      stat_summary(fun.y=median, fun.ymin=median, fun.ymax=median, 
         geom="crossbar", width=0.7) 

ggsave("dotplot_1.png", dotplot_1, width=6, height=4)

enter image description here

來源

2012-08-10 00:16:33 bdemarest

謝謝，這看起來不錯！而且非常簡單，甚至可以治癒我最初對ggplot2的困惑:)我會堅持一段時間思考，看看有沒有人知道如何在格子或基礎圖形中做到這一點。 – Backlin 2012-08-10 08:04:32

實現了[beeswarm package]（http://cran.r-project.org/web/packages/beeswarm/index.html）我上面提到的是使用標準的圖形系統，所以我已經有兩種很好的方法來實現它了。 – Backlin 2012-08-10 08:12:15

要調整數據點的大小，請向geom_dotplot（）添加一個dotsize選項 – wint3rschlaefer 2015-08-25 12:15:21

抖動點時避免重疊

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