自動化RStudio處理RMarkdown？

Question

我有一個RMarkdown文件，我用它來生成一個漂亮的HTML報告。 問題是，我想能夠自動化它，以便它可以在無頭服務器上運行。因此，在那裏沒有人會啓動Rstudio並按下'knithtml'按鈕，似乎Rstudio正在做很多額外的魔術，比如擁有它自己的pandoc版本，運行所有必要的命令，應用css風格等。

當我按下'knithtml'按鈕時，如何才能生成Rstudio生成的相同的報告，而只需運行R腳本？

謝謝。

Answer 1

使用

rmarkdown::render("/PATH/TO/YOUR.Rmd", output_file="/PATH/TO/YOUR/OUTPUT.html") 

，而不是嘗試。這假設你已經將庫加載到你的無頭盒上。它將使用系統pandoc，但要確保它是1.12或更高。

這裏的knit2html做什麼（通過 「R降價」 標籤附近的 「控制檯」）：

這裏是一個並排側。左鍵單擊該按鈕，右鍵運行命令：