Python網絡x：邊緣收縮

Question

我有一個NetworkX圖。我想知道如何在多個節點之間做edge contraction。

例如，如果我想承攬X，Y和Z：

  _ node A _ 
     _/ |  \_ 
node X --- node Y --- node Z 

將成爲

  node A 
      |  
      node XYZ (or whatever X/Y/Z) 

圖形創作是沒有問題的。有用。我想通過合併具有相同「含義」的節點來縮小圖形：我稱之爲「end lvl」（節點名稱長度等於7）並鏈接在一起的節點。

我發現在NetworkX凝聚作用，所以我嘗試使用它：

# edge contraction for same nodes 
# for each node, get the links to other nodes "end lvl" 
# if there is such a link, it means that these node are 
# the sames 
# 
# copy graph 
I = G 
for n,d in G.nodes(data=True): 
    if n in I.nodes(): 
     if len(n) == 7: 
      # list of nodes adjacent to n : filter only "end lvl" nodes 
      neighbors = [ node for node in I.neighbors(n) if len(node) == 7 ] 
      nodes_to_merges = neighbors.append(n) 
      I = nx.condensation(I,scc=nodes_to_merges) 

當我轉換成JSON我得到的東西是：

{"directed": true, "graph": [], "nodes": [{"id": 0}], "links": [], "multigraph": false} 

有一個問題，因爲你可以看到...

對函數的引用是here。

Answer 1

如何：

add_node(XYZ) 
add_edge(XYZ, A) 
for edge incident on (X, Y, Z): 
    v = nodes in edge not in (X, Y, Z, A) 
    if v: 
     remove_edge(edge) 
     add_edge(v, XYZ) 
for node in (X, Y, Z): 
    remove_node(node) 

Answer 2

，而不是試圖用nx.condensation（這是指承包強連通分量，而不是組一般節點）使用這些功能：

http://networkx.readthedocs.io/en/stable/reference/classes.graph.html#adding-and-removing-nodes-and-edges

刪除除了一個摺疊節點之外的所有節點並重新連接它們的節點。