谷歌基因組學的工作永遠不會結束

我們正在使用谷歌基因組學ReadGroupSets來存儲數據對齊（BAM文件）和它驚人的運行，直到昨天...谷歌基因組學的工作永遠不會結束

昨天（2016年8月29日）我們的導入作業（ 方法：readgroupsets.import）開始「運行」狀態，但直到現在還沒有達到「完成」或錯誤消息。

其他人是否遇到同樣的問題？

例如：作業運行1天，並且沒有顯示錯誤消息。

$ gcloud alpha genomics operations describe identifier 

done: false 
metadata: 
    '@type': type.googleapis.com/google.genomics.v1.OperationMetadata 
    clientId: '' 
    createTime: '2016-08-30T01:08:57.000Z' 
    events: [] 
    projectId: xxxxxxx 
    request: 
    '@type': type.googleapis.com/google.genomics.v1.ImportReadGroupSetsRequest 
    datasetId: 'xxx' 
    partitionStrategy: PER_FILE_PER_SAMPLE 
    referenceSetId: '' 
    sourceUris: 
    - gs://xxx/yyy/zzz.bam 
name: operations/identifier

昨天我們還必須在獲得在谷歌的存儲對象的「公共鏈接」臨時有事，但是這一次，現在是確定的。

編輯：我也試圖觸發使用gcloud CLI導入作業，指着另一個數據集，併到另一個雲項目，但工作仍停留在「運行」。

edit2：我使用Google Genomics約3個月，並已成功導入400多個路線。只有這個星期我有問題。

edit3：已解決。我的所有工作都順利結束。

來源

2016-08-30 Lucas Taniguti

@ paul-grosu我重新提交作業，並且這次在事件中顯示預期的msg（無參考設置Id），但作業運行2h。這些進口工作通常不超過40分鐘。 –

嗨盧卡斯，我在前一天處理了OperationMetadata API文檔和CH的回覆，以獲得推薦。但梅利莎讓我們知道這個問題源於路徑的不同部分。我回復了Google網上論壇消息以同步到單個線程。希望它很快就會被修復。 Paul –

嗨Lucas，CH和Melissa能夠解決這個問題，現在隊列正在積壓之中。 –