用python讀取二進制文件

我發現使用Python讀取二進制文件特別困難。你能幫我一下嗎？我需要讀取這個文件，這在Fortran 90中很容易被用python讀取二進制文件

int*4 n_particles, n_groups 
real*4 group_id(n_particles) 
read (*) n_particles, n_groups 
read (*) (group_id(j),j=1,n_particles)

詳細閱讀，文件格式爲：

Bytes 1-4 -- The integer 8. 
Bytes 5-8 -- The number of particles, N. 
Bytes 9-12 -- The number of groups. 
Bytes 13-16 -- The integer 8. 
Bytes 17-20 -- The integer 4*N. 
Next many bytes -- The group ID numbers for all the particles. 
Last 4 bytes -- The integer 4*N.

我如何使用Python閱讀本？我嘗試了一切，但沒有奏效。是否有機會在python中使用f90程序，讀取這個二進制文件，然後保存我需要使用的數據？

來源

2012-01-03 Brian

當時這個文件寫的Fortran程序？如果是這樣，它是如何寫入的，因爲默認情況下，Fortran會在寫入文件的每個記錄之前添加其他數據。讀取數據時可能需要注意這一點。 – Chris 2012-01-03 10:02:46

請忽略我之前的評論，整數8和4 * N顯然是這些額外的數據。 – Chris 2012-01-03 10:43:33

此外，請參閱問題的答案[在Python中讀取二進制文件]（http://stackoverflow.com/questions/1035340/reading-binary-file-in-python）。 – Chris 2012-01-03 10:46:53

閱讀二進制文件內容是這樣的：

with open(fileName, mode='rb') as file: # b is important -> binary 
    fileContent = file.read()

然後使用struct.unpack 「解壓」的二進制數據：

起始字節：struct.unpack("iiiii", fileContent[:20])

體：忽略標題字節，尾隨字節（= 24）;剩下的部分構成體，知道體內的字節數做一個整數除4;得到的商數被串'i'相乘以創建解壓方法的正確格式：

struct.unpack("i" * ((len(fileContent) -24) // 4), fileContent[20:-4])

結束字節：struct.unpack("i", fileContent[-4:])

來源

2012-01-03 10:46:19 gecco

非常感謝，但通過您的代碼，我可以讀取開始和結束字節，但不能讀取正文。我得到這個錯誤消息TypeError：不支持的操作數類型（s）//：'str'和'int'。在閱讀我的文件的主體時，能否更好地解釋我的代碼的含義？ – Brian 2012-01-03 11:08:21

一些括號丟失。我更新了我的帖子 – gecco 2012-01-03 11:10:28

我想通了我自己！非常感謝非常有幫助的答案！ – Brian 2012-01-03 11:19:58

一般來說，我建議你看看Python的struct模塊。它是Python的標準，應該很容易將您的問題規範轉換爲適合於struct.unpack()的格式化字符串。

請注意，如果字段之間/周圍存在「不可見」填充，則需要計算出該字段並將其包含在unpack()調用中，否則您將讀取錯誤的位。

讀取文件的內容，以有東西來解壓是很簡單的：

import struct 

data = open("from_fortran.bin", "rb").read() 

(eight, N) = struct.unpack("@II", data)

這拆包前兩個字段，假設他們開始在文件（沒有填充或外來的開始數據），並且還假定本地字節順序（@符號）。格式化字符串中的I表示「無符號整數，32位」。

來源

2012-01-03 10:18:02 unwind

好的，但我甚至不知道如何讀取文件的字節。從我的問題我怎麼能讀取從字節5到8的文件，然後將結果轉換爲一個整數？對不起，但我是Python新手。 – Brian 2012-01-03 10:39:23

您可以使用numpy.fromfile，它可以從文本和二進制文件讀取數據。您將首先使用numpy.dtype構造代表您的文件格式的數據類型，然後使用numpy.fromfile從文件中讀取此類型。

來源

2012-01-03 10:41:29 Chris

容易錯過！文檔有點薄;請參閱https://www.reddit.com/r/Python/comments/19q8nt/psa_consider_using_numpy_if_you_need_to_parse_a/進行一些討論 – lost 2017-03-23 10:55:49

-1

import pickle 
f=open("filename.dat","rb") 
try: 
    while True: 
     x=pickle.load(f) 
     print x 
except EOFError: 
    pass 
f.close()

來源

2017-12-13 16:26:16 Eeshitri

可能值得一點解釋爲什麼這比其他答案更好（或至少一樣好）。 – Phil 2017-12-13 16:38:10

您是否測試了驗證過的Fortran生成的二進制文件？ – agentp 2017-12-13 17:14:56

也解釋它是做什麼的...什麼是泡菜？ pickle.load負載是什麼？它是否加載Fortran流，直接或順序文件？他們是不同的，不兼容。 – 2017-12-13 19:37:40

用python讀取二進制文件

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